موزه ملی تاریخ علوم پزشکی ایران یکی از مهم‌ترین موزه‌های تخصصی کشور است که در تهران، خیابان کارگر شمالی، خیابان فرشی‌مقدم قرار دارد. این موزه با هدف معرفی تاریخ پزشکی، داروسازی، دندانپزشکی و سایر علوم پزشکی در ایران تأسیس شده و زیر نظر دانشگاه علوم پزشکی تهران فعالیت می‌کند. این موزه در تابستان ۱۳۸۰ با مشارکت دانشگاه علوم پزشکی تهران، سازمان میراث فرهنگی و فرهنگستان علوم پزشکی آغاز به کار کرد.
ساختمان موزه متعلق به دوره قاجار است.
این بنا حدود ۱۵۰ سال قدمت دارد و به دستور امیرکبیر به‌عنوان اصطبل و کالسکه‌خانه سلطنتی ساخته شده بود و بعدها به موزه تبدیل شد.