استانداری خراسان جنوبی بالاترین نهاد اجرایی و مدیریتی استان خراسان جنوبی است و بر عملکرد فرمانداری‌ها، بخشداری‌ها و دستگاه‌های اجرایی دولتی در سراسر استان نظارت و هماهنگی دارد. محدوده تحت پوشش استانداری خراسان جنوبی شامل تمامی شهرستان‌ها و مناطق استان است، از جمله: شهرستان بیرجند (مرکز استان)، شهرستان بشرویه، شهرستان درمیان، شهرستان زیرکوه، شهرستان سرایان، شهرستان سربیشه، شهرستان طبس، شهرستان فردوس، شهرستان قاینات، شهرستان نهبندان و شهرستان خوسف. این مجموعه مسئول هماهنگی و نظارت بر مدیریت اجرایی استان، برنامه‌ریزی و توسعه منطقه‌ای، امور اقتصادی و عمرانی، امور اجتماعی و فرهنگی، مدیریت بحران، امنیت و هماهنگی بین دستگاه‌های دولتی در سطح استان خراسان جنوبی است.