موزه شهید نیک‌نژاد اصفهان یکی از موزه‌های تخصصی شهدا در شهر اصفهان است که در ساختمان بنیاد شهید و امور ایثارگران منطقه یک اصفهان قرار دارد. این موزه با هدف حفظ و معرفی آثار، اسناد و یادگارهای شهدای انقلاب اسلامی و دفاع مقدس ایجاد شده و نام خود را از شهید نیک‌نژاد گرفته است. در این مجموعه وسایل شخصی شهدا، وصیت‌نامه‌ها، دست‌نوشته‌ها، تصاویر، اسناد تاریخی و آثار مرتبط با ایثار و شهادت نگهداری و در معرض بازدید قرار دارد.
این موزه در دهه ۱۳۸۰ در بنیاد شهید منطقه یک اصفهان راه‌اندازی شد و از آن زمان به‌عنوان یکی از مراکز فرهنگی حوزه ایثار و شهادت فعالیت می‌کند.