مجموعه جواهرات قدمتی چند صدساله دارد. بخش عمده این جواهرات از دوره صفوی (از اوایل سده ۱۶ میلادی) گردآوری شده و در دورههای افشاریه، زندیه، قاجار و پهلوی نیز بر آن افزوده شده است.
خزانه و موزه در محل کنونی ریشه در انتقال جواهرات به بانک ملی در سال ۱۳۱۶ خورشیدی دارد و پس از ساخت ساختمان جدید، خزانه فعلی در سال ۱۳۳۹ خورشیدی در خیابان فردوسی افتتاح شد.
بنابراین قدمت موزه حدود ۸۷ سال از آغاز شکلگیری آن بهعنوان خزانه ملی (از سال ۱۳۱۶) و حدود ۶۷ سال از استقرار آن در ساختمان فعلی (از سال ۱۳۳۹) میگذرد.