موزه تاریخ تجارت جندی‌شاپور یک موزه خصوصی در شهر شیراز است که در سال ۱۳۹۷ با مجوز وزارت میراث فرهنگی، گردشگری و صنایع‌دستی تأسیس شد. این موزه به همت خسرو رودانی، مجموعه‌دار و بنیان‌گذار موزه، راه‌اندازی شده و با هدف حفظ، پژوهش، مرمت و معرفی آثار تاریخی ایران فعالیت می‌کند.
موضوع اصلی موزه، تاریخ تجارت، بازرگانی و تبادلات فرهنگی ایران در دوره‌های مختلف تاریخی است. در این مجموعه آثار متنوعی از جمله اشیای فلزی، سفال، آبگینه، سنگ، مهر، سکه، زیورآلات، نسخه‌های خطی و آثار باستانی به نمایش گذاشته شده است که بسیاری از آن‌ها از دوره‌های پیش از اسلام تا دوره اسلامی را در بر می‌گیرند.
یکی از ویژگی‌های شاخص این موزه، وجود اولین و مجهزترین کارگاه خصوصی مرمت آثار تاریخی در ایران است. همچنین این موزه دارای کتابخانه‌ای با بیش از ۲۱۰۰ جلد کتاب تخصصی در زمینه باستان‌شناسی، مرمت، حفاظت آثار تاریخی، باستان‌سنجی و گردشگری است و امکانات پژوهشی را برای محققان فراهم کرده است.
این موزه در سال‌های اخیر در رویدادهای بین‌المللی نیز حضور داشته و به‌عنوان نخستین موزه خصوصی ایران در فهرست رتبه‌بندی جهانی موزه‌ها قرار گرفته است. همچنین در سال ۱۴۰۱ در جشنواره بین‌المللی AVICOM وابسته به ایکوم، برای یکی از تولیدات خود مدال برنز دریافت کرد.