فرمانداری بستان‌آباد یکی از نهادهای اجرایی و مدیریتی شهرستان بستان‌آباد در استان آذربایجان شرقی است که وظیفه اصلی آن هماهنگی، برنامه‌ریزی، نظارت و اجرای سیاست‌های دولت در سطح شهرستان می‌باشد. فرمانداری به عنوان نماینده عالی دولت در شهرستان، نقش مهمی در اداره امور عمومی، توسعه منطقه، برقراری هماهنگی میان دستگاه‌های اجرایی و پیگیری مطالبات مردم دارد. این مجموعه زیر نظر استانداری فعالیت می‌کند و فرماندار به عنوان مدیر ارشد اجرایی شهرستان، مسئولیت نظارت و هدایت برعملکرد دستگاه‌های دولتی و خدمات‌رسان را برعهده دارد.
بستان‌آباد در بخش مرکزی استان آذربایجان شرقی قرار گرفته و به دلیل موقعیت جغرافیایی مناسب، نزدیکی به تبریز و برخورداری از ظرفیت‌های کشاورزی، گردشگری و صنعتی، از مناطق مهم استان محسوب می‌شود. فرمانداری بستان‌آباد با هدف مدیریت بهتر امور شهرستان، ایجاد هماهنگی بین ادارات، توسعه زیرساخت‌ها و حمایت از برنامه‌های اجتماعی واقتصادی فعالیت می‌کند. این نهاد نقش مهمی در اجرای طرح‌های عمرانی ، توسعه خدمات عمومی، مدیریت بحران و افزایش رفاه اجتماعی مردم منطقه دارد.
نظارت بر فعالیت ادارات و سازمان‌های دولتی شهرستان یکی از مهم‌ترین وظایف بستان‌آباد است. فرمانداری با برگزاری جلسات ، بررسی مشکلات دستگاه‌ها و پیگیری مصوبات، تلاش می‌کند روند خدمات عمومی به شهروندان را به شکل مطلوب انجام دهد. ادارات مختلف شهرستان مانند اداره کار،جهاد کشاورزی،آموزش و پرورش، شبکه بهداشت و درمان، اداره راه و شهرسازی، منابع طبیعی و سایر مجموعه‌های اجرایی، در چارچوب سیاست‌های دولت و با هماهنگی فرمانداری فعالیت می‌کنند.
فرمانداری بستان‌آباد در حوزه افزایش اقتصادی نیز نقش مهمی دارد. این شهرستان دارای ظرفیت‌های قابل توجهی در دامداری،زمینه کشاورزی، صنایع کوچک و کم و فعالیت‌های تولیدی است. فرمانداری با حمایت از سرمایه‌گذاری، تسهیل روند فعالیت واحدهای تولیدی و پیگیری مشکلات اقتصادی، تلاش می‌کند زمینه رشد وبهبود اقتصادی و ایجاد فرصت‌های شغلی در منطقه را فراهم کند. همچنین برگزاری جلسات با تولیدکنندگان، ازجمله اقداماتی است که برای شناسایی مشکلات انجام می‌شود.
مدیریت امور اجتماعی و فرهنگی شهرستان از دیگر فعالیت های مهم فرمانداری است. این مجموعه با همکاری نهادهای اجتماعی، فرهنگی، آموزشی و برنامه‌هایی برای ارتقای سطح فرهنگی جامعه، حمایت از فعالیت‌های اجتماعی و افزایش مشارکت مردم در امور مختلف اجرا می‌کند. برگزاری جلسات با شوراهای اسلامی شهر و روستا، نهادهای، دهیاران، گروه‌های مردمی فرهنگی از جمله اقداماتی است که فرمانداری برای ارتباط نزدیک‌تر با مردم انجام می‌دهد.
فرمانداری بستان‌آباد همچنین در زمینه مدیریت بحران و حوادث غیرمنتظره مسئولیت مهمی دارد. با توجه به احتمال وقوع حوادثی مانند سیل، زلزله، سرمازدگی و سایر بحران‌های طبیعی، فرمانداری وظیفه هماهنگی میان دستگاه‌های خدماتی و امدادی را بر عهده دارد. تشکیل جلسات ستاد مدیریت بحران، برنامه‌ریزی برای مقابله با حوادث و نظارت بر آمادگی دستگاه‌های مسئول از فعالیت‌های این نهاد در این حوزه است.
از دیگر وظایف فرمانداری می‌توان به برگزاری و نظارت بر انتخاباتی اشاره کرد. فرمانداری به عنوان مجری برگزاری انتخابات در سطح شهرستان، مسئولیت‌هایی مانند هماهنگی با عوامل اجرایی، تشکیل ستاد انتخابات، فراهم کردن امکانات لازم و اجرای قوانین انتخاباتی را بر عهده دارد. هدف اصلی در این بخش، برگزاری انتخاباتی سالم، منظم و مطابق با قوانین کشور است.
فرمانداری بستان‌آباد در زمینه توسعه روستایی نیز نقش قابل توجهی دارد. این مجموعه با همکاری بخشداری‌ها، شوراهای اسلامی و دهیاری‌ها، مشکلات و نیازهای روستاهای اطراف خود را بررسی کرده و برای بهبود وضعیت راه‌ها، آب‌رسانی به مناطق، خدمات عمومی، توسعه کشاورزی و ایجاد امکانات رفاهی تلاش می‌کند.
ساختمان فرمانداری به عنوان مرکز اجرایی، محل مراجعه مردم برای پیگیری مسائل اداری و مشکلات مربوط دولتی است.