فرمانداری بناب یکی از مهم‌ترین نهادهای اجرایی شهرستان بناب در استان آذربایجان شرقی است که وظیفه اصلی آن هماهنگی میان دستگاه‌های دولتی،مدیریت امور اجرایی، پیگیری برنامه‌های توسعه‌ای و نظارت بر اجرای سیاست‌های دولت در سطح شهرستان می‌باشد. این مجموعه به عنوان نماینده دولت در شهرستان فعالیت کرده و فرماندار به عنوان عالی‌ترین مقام اجرایی ، مسئولیت هماهنگی وهدایت فعالیت‌های ادارات و سازمان‌های دولتی را بر عهده دارد. فرمانداری شهرستان بناب در خیابان فرمانداری شهر بناب قرار دارد.
شهرستان بناب در جنوب استان آذربایجان شرقی قرار دارد و به دلیل برخورداری از ظرفیت‌های صنعتی، کشاورزی، تجاری و فرهنگی، یکی از مناطق مهم این استان به حساب می آید. این شهرستان با مرکزیت شهر بناب، دارای بخش مجموعه ای و مرکزی از روستاها و مناطق پیرامونی است و این نهاد نقش مهمی درمدیریت امور و برنامه‌ریزی این مناطق دارد. شهرستان بناب در سال ۱۳۶۸ به عنوان شهرستانی مستقل در تقسیمات کشوری ایجاد شد و از آن زمان فرمانداری این شهرستان مسئولیت اداره امور اجرایی منطقه را بر عهده گرفته است.
یکی از مهم‌ترین وظایف فرمانداری بناب، ایجاد هماهنگی میان و دستگاه‌های اجرایی و ادارات شهرستان است. با برگزاری جلسات شورای اداری، پیگیری مصوبات و حل مشکلات موجود، بررسی عملکرد سازمان‌ها تلاش می‌کند خدمات عمومی با کیفیت بیشتری به مردم ارائه شود. اداراتی مثل شبکه بهداشت و درمان،آموزش و پرورش، جهاد کشاورزی، اداره تعاون، اداره راه و شهرسازی، کار و رفاه اجتماعی و سایر دستگاه‌های اجرایی شهرستان، در چارچوب سیاست‌های دولت و با هماهنگی فرمانداری فعالیت می‌کنند.
فرمانداری بناب در زمینه توسعه اقتصادی شهرستان نیز نقش مهمی دارد. بناب به عنوان منطقه‌ای با سابقه طولانی در تولید محصولات مختلف و کشاورزی، دامداری، ظرفیت‌های قابل توجهی در حوزه‌های کشاورزی، صنایع غذایی و صنایع تبدیلی دارد. فرمانداری با حمایت از سرمایه‌گذاری، بررسی مشکلات واحدهای تولیدی، تسهیل روند فعالیت‌های اقتصادی و ارتباط با بخش خصوصی، تلاش می‌کند زمینه رونق اقتصادی و ایجاد اشتغال در شهرستان را فراهم کند. ظرفیت‌های کشاورزی بناب و فعالیت صنایع مرتبط، از عوامل مهم توسعه اقتصادی این منطقه اشاره می شود.
برنامه‌ریزی برای توسعه زیرساخت‌های روستایی و شهری از دیگر فعالیت های فرمانداری بناب است. این مجموعه با همکاری دستگاه‌های مرتبط، موضوعاتی مثل بهبود وضعیت روستاها، توسعه خدمات عمومی، تأمین امکانات رفاهی و اجرای طرح‌های عمرانی را پیگیری می‌کند. همچنین فرمانداری با همکاری شوراهای اسلامی شهر و روستا و دهیاری‌ها، سعی می‌کند نیازهای مناطق مختلف شناسایی و برای رفع آن‌ها برنامه‌ریزی شود.
در حوزه فرهنگی و اجتماعی نیز فرمانداری بناب نقش هماهنگ‌کننده دارد. حمایت از همکاری با نهادهای آموزشی و فرهنگی، برنامه‌های فرهنگی، افزایش مشارکت اجتماعی مردم و رسیدگی به مسائل اجتماعی شهرستان از جمله وظایف این مجموعه است. فرمانداری تلاش می‌کند با ارتباط مستقیم با مردم، مسئولان محلی و گروه‌های مختلف اجتماعی، زمینه تعامل بیشتر میان جامعه و دستگاه‌های اجرایی را فراهم کند.
مدیریت بحران یکی دیگر از مسئولیت‌های مهم فرمانداری بناب است. این نهاد به عنوان مسئول هماهنگی ستاد مدیریت بحران شهرستان، وظیفه دارد در شرایطی مانند سیل، زلزله، خشکسالی، سرمازدگی یا سایر حوادث غیرمنتظره هماهنگی لازم را میان دستگاه‌های خدماتی و اجرایی و امدادی ایجاد کند. برگزاری جلسات آمادگی، بررسی امکانات موجود و برنامه‌ریزی برای کاهش خسارت‌های احتمالی از فعالیت‌های مهم فرمانداری در این زمینه است.
از دیگر اقدامات فرمانداری بناب می‌توان به پیگیری امور مربوط به روستاها، رسیدگی به مشکلات عمومی شهروندان، حمایت از توسعه مناطق کمتر برخوردار و ایجاد ارتباط میان مردم و مسئولان اشاره کرد. این مجموعه به عنوان پل ارتباطی میان دولت و مردم، مشکلات شهروندان را دریافت کرده و برای حل آن‌ها از طریق دستگاه‌های مربوطه اقدام می‌نماید.