موزه تاریخ طبیعی خراسان جنوبی یکی از مراکز علمی، آموزشی و پژوهشی مهم استان است که در شهر بیرجند فعالیت می‌کند و با هدف معرفی تنوع زیستی، حیات‌وحش و ویژگی‌های طبیعی خراسان جنوبی تأسیس شده است. در این موزه مجموعه‌ای ارزشمند از نمونه‌های تاکسیدرمی‌شده پستانداران، پرندگان، خزندگان، آبزیان و حشرات، همچنین سنگ‌ها، کانی‌ها، فسیل‌ها و نمونه‌های گیاهی نگهداری و به نمایش گذاشته شده است. آثار این موزه بیانگر تنوع اقلیمی و زیستی استان بوده و بازدیدکنندگان را با گونه‌های جانوری و گیاهی بومی، گونه‌های در معرض تهدید، زیستگاه‌های طبیعی و اهمیت حفاظت از محیط‌زیست آشنا می‌کند. بخش‌های مختلف موزه با ارائه اطلاعات علمی درباره زمین‌شناسی، اکوسیستم‌های بیابانی، کوهستانی و حیات‌وحش منطقه، نقش مهمی در آموزش دانش‌آموزان، دانشجویان و علاقه‌مندان به علوم طبیعی ایفا می‌کنند. موزه تاریخ طبیعی خراسان جنوبی علاوه بر ارزش آموزشی، به‌عنوان یکی از جاذبه‌های علمی و فرهنگی بیرجند شناخته می‌شود و در معرفی میراث طبیعی و تنوع زیستی استان نقش مؤثری دارد.